Thế Vinh Nguyễn
Nailil Husna (フロンティア医科学専攻・LPDP Scholar)
Aness Kouar (研究生、国費留学生)
筑波大学の生物学類を2000年3月に卒業後、大学院(米国)、ポスドク(英国)、セカンドポスドク(シンガポール)の長期留学を経て2014年2月に帰国しました。これまで、研究材料としては出芽酵母、培養細胞、幹細胞、マウス、臨床検体を扱い、それぞれの系での多様な実験手技を学び、ゲノミクスデータのインフォマティクス解析や民間企業との共同研究なども通して幅広い経験を積んできましたが、「遺伝情報が必要な時に必要な場所で、正確に読み出される仕組み」を一貫して研究しています。
桐医会会報にご挨拶を書かせていただきました。リンクの18ページです。
学歴
2005年 Ph.D. コールドスプリングハーバー研究所ワトソンスクールオブバイオロジカルサイエンス
2000年 学士 筑波大学第二学群生物学類
職歴
2005-2008年 キャンサーリサーチUK ロンドン研究所 リサーチフェロー
2006年 日本学術振興会海外特別研究員
2006-2008年 ヒューマンフロンティアサイエンスプログラム ロングタームフェロー
2008-2014年 シンガポールゲノム研究所 リサーチアソシエイト
2014-2019年 筑波大学医学医療系 准教授
2018年- LSIメディエンス社(筑波大学、クロスアポイントメント制度)シニアリサーチフェロー
2018年- ロボティック・バイオロジー・インスティテュート社 リサーチアドバイザー
2019年- 筑波大学医学医療系 教授
2020年- Universitas Indonesia, Faculty of Medicine, 客員教授
Muratani M, Deng N, Ooi WF, Lin SJ,.... Tan P. Nanoscale chromatin profiling of gastric
adenocarcinoma reveals cancer-associated cryptic promoters and somatically
acquired regulatory elements. (2014) Nature Communications. 5, 4361.
Kumar V, Muratani M, Rayan NA, Kraus P, Lufkin T, Ng HH, Prabhakar S. (2013) Insights from
uniform, optimal signal processing of next-gen tag profiles. Nature Biotechnology.
31(7), 615-22.
Ng JH*, Kumar V*, Muratani M*, Kraus P, Yeo JC, Yaw LP, Xue K, Lufkin T, Prabhakar S, Ng HH. (2013) In vivo epigenomic profiling of germ cells reveals germ cell molecular signatures. Developmental Cell. 24(3), 324-33.
Wang X, Muratani M, Tansey WP, Ptashne M. (2010) Proteolytic instability and the action of
nonclassical transcriptional activators, Current Biology. 20(9), 868-71.
Muratani M, Kung C, Shokat KM, Tansey WP. (2005) The F box protein Dsg1/Mdm30 is
a transcriptional coactivator that stimulates Gal4 turnover and cotranscriptional
mRNA processing. Cell. 120(6):887-99.
Muratani M, Tansey WP. (2003) How the ubiquitin-proteasome system controls transcription. Nature Reviews Molecular and Cellular Biology, 4(3), 192-201.
Muratani M*, Gerlich D*, Janicki SM, Gebhard M, Eils R, Spector DL. (2002) Metabolic-energy-dependent
movement of PML bodies within the mammalian cell nucleus. Nature Cell Biology.
4(2):106-10.
高校・大学までは卓球に全力を注いでいました。現在は、次世代シーケンス解析と宇宙医学・生命科学に興味を持ち、村谷研究室ではバイオインフォマティクス解析を用いた宇宙環境応答バイオマーカー候補の同定をテーマにしています。村谷研究室は次世代シーケンス解析を用いた共同研究や解析サービスを行っているため、自身の研究のみならず民間企業や他の研究室の先生とのディスカッション等の機会があり、幅広い分野の知識に触れることができます。また、留学生が多いため英語をほぼ共通言語としており、日本にいながら海外留学しているような経験ができることもポイントです。日々新しいこと学ことができ、楽しく成長させてもらっています。
Fujita SI, Rutter L, Ong Q, Muratani M. (2020) Integrated RNA-seq Analysis Indicates Asynchrony in Clock Genes between Tissues under Spaceflight. Life. 10(9):E196.
Yoshida K, Maekawa T, Ly NH, Fujita SI, Muratani M, Ando M, Katou Y, Araki H, Miura F, Shirahige K, Okada M,
Ito T, Chatton B, Ishii S. (2020) ATF7-Dependent Epigenetic Changes Are
Required for the Intergenerational Effect of a Paternal Low-Protein Diet.
Mol Cell. 78(3):445-458.e6.
Horie K, Sasanuma H, Kudo T, Fujita SI, Miyauchi M, Miyao T, Seki T, Akiyama N, Takakura Y, Shimbo M, Jeon H,
Shirakawa M, Shiba D, Yoshida N, Muratani M, Takahashi S, Akiyama T. (2019)
Down-regulation of GATA1-dependent erythrocyte-related genes in the spleens
of mice exposed to a space travel. Sci Rep. 9(1):7654.
I got my Bachelor and Master degrees in
Biotechnology at International University of Ho Chi Minh city, Vietnam. At
start, my research interests include investigating disease genomics, simulating
proteins interaction, and screening for potential drugs using bioinformatics
approach. Since 2017, I have enrolled in PhD program in Biomedical Sciences at
Tsukuba University (Japan) under MEXT scholarship. My PhD project is using
integrative RNA-seq and ChIP-seq analysis for clinical Japanese lung cancer
patients. This is the pilot study as we examine the work-flow of analysis on
clinical samples isolated by laser captured micro-dissection (LMD) machine. We
proposed to give better gene expression and epigenomic signal from purer
disease samples isolated by LMD. One of my goals is to identify potential SNPs
or somatic mutations occurred at the chromatin regulatory regions that
associate with lung cancer development and progression. This project is a
collaboration with Pathology department of Tsukuba University Hospital.
I graduated at Vietnam national
university Ho Chi Minh city - university of science in Biotechnology. I worked
as technician at Center for Molecular and Biomedicine, Ho Chi MInh University
of Medicine and Pharmacy for 6 years. From 2019, I have been studying Master
degree in University of Tsukuba about Medical Sciences. My goal is become
scientist in Genome Biology.
Do, M. D., Le, L. G. H., Dang, T. N., Nguyen, N. H., Vu, H. A., & Mai, T. P. (2020). High-Resolution HLA Typing
of HLA-A,-B,-C,-DRB1, and-DQB1 in Kinh Vietnamese by Using Next-Generation
Sequencing. Frontiers in Genetics, 11, 383.
Naili is a new member joined to the lab in 2020 April. She did undergraduate study in biological sciences, Universitas Gadjah Mada in
Indonesia.She works on data mining, analysis and visualization to help resource allocation
in genomics-related R&D and helthcare. Her study is supported by LPDP,
Indonesian scholarship.
〒305-8575
茨城県つくば市天王台1-1-1
TEL 029-853-7645
FAX 029-853-3925
MAIL muratani@md.tsukuba.ac.jp