Papers

  • 【ヘルスケア・機械学習】 Jun Komiyama, Takehiro Sugiyama, Masao Iwagami, Miho Ishimaru, Yu Sun, Hiroki Matsui, Keitaro Kume, Masaru Sanuki, Teruyuki Koyama, Genta Kato, Yukiko Mori, Hiroaki Ueshima, Nanako Tamiya, Hospital-Level Variation in Cardiac Rehabilitation After Myocardial Infarction in Japan During Fiscal Years 2014-2015 Using the National Database, Circulation Reports, 2023, Volume 5, Issue 5, Pages 177-186, Released on J-STAGE May 10, 2023, Advance online publication April 12, 2023, Online ISSN 2434-0790, https://doi.org/10.1253/circrep.CR-22-0113, https://www.jstage.jst.go.jp/article/circrep/5/5/5_CR-22-0113/_article/-char/en
  • 【寄生虫・BioInformatics】Keitaro Kume, Tsubasa Gen, Kazutaka Abe, Hiroshi Komatsuzaki, Euki Yazaki, Goro Tanifuji, Ryoma Kamikawa, Yuji Inagaki, Tetsuo Hashimoto, Transcriptome data sets of free-living diplomonads, Treponema sp., and Hexamita sp., MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, 2023, e0050623, https://doi.org/10.1128/MRA.00506-23
  • 【ヘルスケア・機械学習】Atsushi Ikeda, Kazuya Izumi, Kensuke Katori, Hirokazu Nosato, Keita Kobayashi, Shuhei Suzuki, Shuya Kandori, Masaru Sanuki, Yoichi Ochiai, and Prof. Hiroyuki Nishiyama, Objective evaluation of gaze location patterns using eye tracking during cystoscopy and artificial intelligence-assisted lesion detection https://doi.org/10.1089/end.2023.0699 Published Online: 25 March 2024

Talks

  • 【数式処理】 讃岐 勝、Bezout-Hankel行列の前処理による近似GCD計算の安定化 、日本数式処理学会第32回大会 (2023年6月9日-6月11日)
  • 【教育工学】 讃岐 勝, 柳川 信、異なる学習形態から得られる出席ログの解析を目指したログの可視化の検証、第48回教育システム情報学会全国大会(2023年8月29日-8月31日)
  • 【教育工学】 讃岐 勝、対面授業に戻ることによるオンデマンドコンテンツの視聴方法の変化 ―筑波大学医学類の場合―、第18回医療系eラーニング全国交流会年次大会(2023年12月16日-12月17日)
  • 【数式処理】 讃岐 勝、Bezout-Hankel行列の前処理に係る有効性の事前判定法、RIMS 共同研究 (公開型)Computer Algebra -- Theory and its Applications (2023年12月18日-12月20日)
  • 【数式処理】 佐々木 建昭・讃岐 勝・稲葉 大樹、プレート境界型地震に対する含特異面数学モデルの構築、RIMS 共同研究 (公開型)Computer Algebra -- Theory and its Applications (2023年12月18日-12月20日)
  • 【寄生虫・BioInformatics】久米 慶太郎、若島 朋幸、厳 翼、岩本 亮介、井上 貴史、谷藤 吾朗、神川 龍馬、稲垣 祐司、橋本 哲男、ディプロモナス類の寄生虫化に伴う遺伝子レパートリーの変化:近縁自由生活種とのオルソログ比較解析、第93回日本寄生虫学会大会、(2024年03月09日-03月10日)
  • 【寄生虫】小金丸 利隆、田村 嘉孝、星 康貴、久米 慶太郎、橋本 哲男、奈良 武司、Giardia intestinalis とその自由生活性近縁種におけるAcetyl-CoA Synthetase (ACS)の比較解析、第93回日本寄生虫学会大会、(2024年03月09-03月10日)

Papers

  • 【ヘルスケア・NDB】 Mori T, Komiyama J, Fujii T, Sanuki M, Kume K, Kato G, Mori Y, Ueshima H, Matsui H, Tamiya N, Sugiyama T. Medical expenditures for fragility hip fracture in Japan: a study using the nationwide health insurance claims database. Arch Osteoporos, 17, 61, https://doi.org/10.1007/s11657-022-01096-8, 2022.
  • 【BioInformatics】Ryoma Kamikawa, Takako Mochizuki, Mika Sakamoto, Yasuhiro Tanizawa, Takuro Nakayama, Ryo Onuma, Ugo Cenci, Daniel Moog, Samuel Speak, Krisztina Sarkozi, Andrew Toseland, Cock Van Oosterhout, Kaori Oyama, Misako Kato, Keitaro Kume, Motoki Kayama, Tomonori Azuma, Ken-ichiro Ishii, Hideaki Miyashita, Bernard Henrissat, Vincent Lombard, Joe Win, Sophien Kamoun, Yuichiro Kashiyama, Shigeki Mayama, Shin-ya Miyagishima, Goro Tanifuji, Thomas Mock, and Yasukazu Nakamura, Genome evolution of a nonparasitic secondary heterotroph,the diatom. Science advances/8(17)/p.eabi5075, 2022-04-29, doi:10.1126/sciadv.abi5075
  • 【BioInformatics】Euki Yazaki, Akinori Yabuki, Ayaka Imaizumi, Keitaro Kume , Tetsuo Hashimoto and Yuji Inagaki, The closest relative of Archaeplastida is revealed by phylogenomic analyses that include Microheliella maris. Open Biology/12(4)/p.210376, 2022-04, doi:10.1098/rsob.210376
  • 【寄生虫】Arisue Nobuko, Honma Hajime, Kume Keitaro, Hashimoto Tetsuo, Progress in understanding the phylogeny of the Plasmodium vivax lineage. PARASITOLOGY INTERNATIONAL/87, 2022-04, doi:10.1016/j.parint.2021.102507
  • 【ヘルスケア・NDB】 Yu Sun, Masao Iwagami, Jun Komiyama, Takehiro Sugiyama, Ryota Inokuchi, Nobuo Sakata, Tomoko Ito, Satoru Yoshie, Hiroki Matsui, Keitaro Kume, Masaru Sanuki, Genta Kato, Yukiko Mori, Hiroaki Ueshima, Nanako Tamiya. The Effect of Home Care Support Clinics on Hospital Readmission in Heart Failure Patients in Japan. Journal of general internal medicine, doi:10.1007/s11606-023-08030-9, 2023-01-17
  • 【ヘルスケア・NDB】 Yu Sun, Masao Iwagami, Jun Komiyama, Takehiro Sugiyama, Ryota Inokuchi, Nobuo Sakata, Tomoko Ito, Satoru Yoshie, Hiroki Matsui, Keitaro Kume, Masaru Sanuki, Genta Kato, Yukiko Mori, Hiroaki Ueshima, Nanako Tamiya.Association between types of home healthcare and emergency house calls, hospitalization, and end-of-life care in Japan.Journal of the American Geriatrics Society, https://doi.org/10.1111/jgs.18268 2023-02-15
  • 【ヘルスケア・機械学習】 Yuki Oba, Taro Tezuka, Masaru Sanuki, and Yukiko Wagatsuma, Interpretations of Predictive Models for Lifestyle-related Diseases at Multiple Time Intervals, Lecture Notes in Artificial Intelligence 13713, Lecture Notes in Computer Science/eBook/pp.293-308, 2023-03
  • 【BioInformatics・寄生虫】(* Equal contribution) Ikuko Yuyama*, Keitaro Kume*, Takumi Tamura, Yuji Inagaki, Tetsuo Hashimoto, Draft genome sequence of Aduncisulcus paluster, a free-living microaerophilic eukaryote belonging to Fornicata, MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, 2023, e0053922, https://doi.org/10.1128/mra.00539-22
  • 【BioInformatics・AI】Ryo Harada, Keitaro Kume, Kazumasa Horie, Takuro Nakayama, Yuji Inagaki, Toshiyuki Amagasa, AtLASS: A scheme for end-to-end prediction of splice sites using attention-based bi-LSTM, IPSJ Transactions on Bioinformatics, https://doi.org/10.2197/ipsjtbio.16.20

Papers Published in Conference Proceedings

  • 【AI】 Kagawa, R., Shirasuna, M., Ikeda, A., Sanuki, M., Honda, H., & Nosato, H. (2022). One-second Boosting: A Simple and Cost-effective Intervention that Promotes the Optimal Allocation of Cognitive Resources. Proceedings of the Annual Meeting of the Cognitive Science Society, 44. Retrieved from https://escholarship.org/uc/item/2bm0v62h
  • 【ヘルスケア・機械学習】 Yuki Oba, Taro Tezuka, Masaru Sanuki, and Yukiko Wagatsuma, Interpretations of Predictive Models for Lifestyle-related Diseases at Multiple Time Intervals, European Conference on Machine Learning and Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases (ECML-PKDD2022), Grenoble, France, September 19-23, 2022. (to appear)

Talks

  • 【人工知能】 香川 璃奈, 白砂大, 池田篤史, 讃岐勝, 本田秀仁, 野里博和、1秒待つことによるアノテーション品質の向上:作業能力向上と心的負担のトレードオフを考慮した作業環境への介入、第36回人工知能学会全国大会
  • 【数式処理】 讃岐 勝、ブローアップによる多変数多項式の因数分解の良条件化、日本数式処理学会第31回大会 (2022年6月17日-6月19日)
  • 【医学教育】 宮内順也, 後藤美智, 宇田川惇, 木村友和, 柳川信, 讃岐勝, 三輪佳宏、学生-教職員の相互協力による医学教育DX推進事例~時間割Webサイトの設立経緯とその特徴~、第54回日本医学教育学会大会 (2022年8月6日)
  • 【教育工学】 讃岐 勝, 柳川 信、種々の授業形態における出席管理の方法と行動変容、第17回医療系eラーニング全国交流会年次大会(2022年11月26日-11月27日)
  • 【数式処理】 讃岐 勝、前処理によるBarnettの定理に基づく近似GCD計算の安定化、、RIMS 共同研究 (公開型)Computer Algebra -- Theory and its Applications (2022年12月19日-12月21日)
  • 【ヘルスケア】 孫 瑜, 岩上将夫, 小宮山潤, 杉山雄大, 井口竜太, 佐方信夫, 伊藤智子, 吉江悟, 讃岐勝, 久米慶太郎, 松居宏樹, 植嶋大...、全国レセプトデータを用いた在宅療養支援診療所の心不全再入院に対する予防効果の検討、第81回日本公衆衛生学会総会/2022
  • 【ヘルスケア】 孫瑜, 岩上 将夫, 小宮山潤, 杉山 雄大, 井口 竜太, 佐方信夫, 伊藤智子, 吉江悟, 讃岐勝, 久米慶太郎, 松居宏樹...、全国レセプトデータを用いた在宅療養支援診療所の心不全再入院に対する予防、第81回日本公衆衛生学会/2022-10-7--2022-10-9
  • 【BioInformatics・AI】原田 亮, 久米 慶太郎, 堀江 和正, 中山 卓郎, 稲垣 祐司, 天笠 俊之...、AtLASS: A Scheme for end-to-end prediction of splice sites using attention-based, bi-LSTM、第74回バイオ情報学(SIGBIO)研究会(2023年06月29日-07月01日)

総説

  • 【がんプロ】 Jaejeong Kim, Yohei Owada, Kosuke Kojo, Masaru Sanuki, Yuichi Takiguchi, Ken Shirabe, Ikuo Sekine, Hiroyuki Nishiyama, Hirotake Abe, Kazuhiko Kato, Nariaki Matsuura, Tatsuya Oda 、関東がん専門医療人養成拠点―がんプロ全国E-Learning クラウドの熟成と発展―、癌と化学療法 Volume 49, Issue 5, 520 - 524 (2022): http://www.pieronline.jp/content/article/0385-0684/49050/520

Others

  • 【数式処理】 讃岐 勝、桁落ち誤差からはじまる研究、数式処理、vol.28, no.1, 巻頭文

学内でのセミナー・講演会など

Papers

  • 【ヘルスケア・機械学習】 Yuki Oba, Taro Tezuka , Masaru Sanuki, Yukiko Wagatsuma (2021) Analysis of Health Screening Records Using Interpretations of Predictive Models. In: Tucker A., Henriques Abreu P., Cardoso J., Pereira Rodrigues P., Riano D. (eds) Artificial Intelligence in Medicine. AIME 2021. Lecture Notes in Computer Science, Springer, Cham, vol 12721, 146-151. 10.1007/978-3-030-77211-6_15
  • 【ヘルスケア・機械学習】 Yuki Oba, Taro Tezuka, Masaru Sanuki, Yukiko Wagatsuma, Interpretable prediction of diabetes from tabular health screening records using an attentional neural network, Proceedings of the 8th IEEE International Conference on Data Science and Advanced Analytics (DSAA2021), October 2021. https://doi.org/10.1109/DSAA53316.2021.9564151
  • 【Computer Algebra/数式処理】 T. Sasaki, M. Sanuki, D. Inaba : Proposal of Multivariate Polynomial Arithmetic in a Specified Width of High- or Low-Exponents, Proc. of SYNACS2021, IEEE, 2021, 25-32. (electronic publishing) https://doi.org/10.1109/SYNASC54541.2021.00016
  • 【BioInformatics】Yazaki Euki, Yabuki Akinori, Imaizumi Ayaka, Kume Keitaro..., Phylogenomics invokes the clade housing Cryptista, Archaeplastida, and Microheliella maris. bioRχiv, 2021-08, doi:10.1101/2021.08.29.458128

Talks

  • 【教育工学】 讃岐 勝・柳川 信・片山 京子、ハイフレックス型授業における出席管理の1例、JSiSE Research Report、36(1)、2021, 59-62 (教育システム情報学会(JSiSE) 2021年度第1回研究会、2021年5月8日)
  • 【Computer Algebra/数式処理】 Tateaki Sasaki, Fujio Kako, Masaru Sanuki, Daiju Inaba, An Attempt to Enhance Buchberger's Algorithm by Using PRSs and GCDs (26th International Conference on Applications of Computer Algebra, 2021.07.23-07.27)
  • 【Computer Algebra/数式処理】 Tateaki Sasaki, Masaru Sanuki, Inaba Daiju, Proposal of Multivariate Polynomial Arithmetic in a Specified Range of Higher- or Lower-exponents (26th International Conference on Applications of Computer Algebra, 2021.07.23-07.27)
  • 【Computer Algebra/数式処理】 Masaru Sanuki, Multivariate Approximate GCD Computation Using Null Space of Subresultant Matrix within Polynomials: Non-singular Case (26th International Conference on Applications of Computer Algebra, 2021.07.23-07.27)
  • 【医療AI】 荒木渉吾、副島裕佳子、吉岡英樹、神亮太、樋坂章博.「SOLVD試験の心不全患者の予後に関わるバイオマーカーの統合的評価」 第65回日本薬学会関東支部大会.2021年9月11日(web開催)
  • 【医療AI】 中里裕貴、 副島裕佳子、吉岡英樹、 神亮太、樋坂章博.「Causal Forestを用いた機械学習による慢性心不全における運動療法の有害因子検出の試み」第65回日本薬学会関東支部大会.2021年9月11日(web開催)
  • 【医療AI】 星野悠介、吉岡英樹、 樋坂章博.「機械学習を用いた薬物吸収に及ぼす食事の影響の予測」第65回日本薬学会関東支部大会.2021年9月11日(web開催)
  • 【Medical AI】 Hideki Yoshioka, Shinya Kawamatsu, Ryota Jin, Shogo Araki, Hiromi Sato, Yasunori Sato, Akihiro Hisaka. "Scores of Health-Related Quality of Life Questionnaire Worsen Consistently in Patients with COPD: Estimating Disease Progression over 30 Years by SReFT with Individual Data Collected in SUMMIT Trial". The Twelfth American Conference on Pharmacometrics (ACoP12), November 8-12, 2021 (virtual).
  • 【Medical AI】 Ryota Jin, Hideki Yoshioka, Akihiro Hisaka. "Analysis of Long-term Progression of Parkinson's Disease and Covariate Effects of Sex and LRRK2-Associated Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) by SReFT". The Twelfth American Conference on Pharmacometrics (ACoP12), November 8-12, 2021 (virtual).
  • 【人工知能】 香川璃奈, 池田 篤史, 讃岐 勝, 野里 博和: アノテーション環境への簡便な介入がデータ品質に及ぼす影響, 第11回医用人工知能研究会, 2021年11月
  • 【教育工学】 讃岐 勝・金 在ジョン・福重瑞穂・柳川 信・奥富由規子・渡邊行乃・森尾貴広・大庭良介、オープンな学習プラットフォームの開発と提供に向けて、第16回医療系eラーニング全国交流会年次大会 プログラム・要旨集、2021, 34-37(2021年12月18日-19日)
  • 【教育工学】 柳川 信・讃岐 勝、ユーザの視聴セッションに注目した簡易BIツールの 有用性、第16回医療系eラーニング全国交流会年次大会 プログラム・要旨集、2021, 41-42(2021年12月18日-19日)
  • 【数式処理】 讃岐勝、斉次な多変数多項式の近似GCD算法の比較、RIMS 共同研究 (公開型)Computer Algebra -- Theory and its Applications(2021年12月20日-月22日)

招待講演

  • 【医療AI】 吉岡英樹.「疾患リスク解析における機械学習の有用性と課題」 第65回日本薬学会関東支部大会 2021年9月11日(web開催)

Papers

  • 【BioInformatics】 (* Equal contribution) Yuki Nishimura*, Keitaro Kume*, Keito Sonehara, Goro Tanifuji, Takashi Shiratori, Ken-ichiro Ishida, Tetsuo Hashimoto, Yuji Inagaki, Moriya Ohkuma, Mitochondrial genomes of Hemiarma marina and Leucocryptos marina revised the evolution of cytochrome c maturation in Cryptista, Proc Biol Sci, 2020-05, doi: 10.3389/fevo.2020.00140.
  • 【BioInformatics】 Euki Yazaki, Keitaro Kume, Takashi Shiratori, Yana Eglit, Goro Tanifuji, Ryo Harada, Alastair G B Simpson, Ken-Ichiro Ishida, Tetsuo Hashimoto, Yuji Inagaki, Barthelonids represent a deep-branching metamonad clade with mitochondrion-related organelles predicted to generate no ATP, Front Ecol Evol, 2020-09, doi: 10.1098/rspb.2020.1538.
  • 【応用数学(次元削減)】 Takahiro Yano, Yasunori Futamura, Akira Imakura and Tetsuya Sakurai, Efficient Implementation of a Dimensionality Reduction Method Using a Complex Moment-Based Subspace, In: Proceedings of the International Conference on High Performance Computing in Asia-Pacific Region (HPC Asia 2021), pp.83-89, 2021. doi: 【10.1145/3432261.3432267】(https://doi.org/10.1145/3432261.3432267)

Talks

  • 【教育工学】 讃岐勝・柳川信・片山京子、筑波大学医学部門におけるオンライン授業 ―部局で配信サーバを運用するケース―、医療系eラーニング全国交流会(JMeL)プチ交流会 (2020年7月4日)
  • 【教育工学】 讃岐 勝・柳川 信・片山 京子、部局におけるオンデマンド配信サーバを持つ意義-筑波大学医学系の例から-、第45回教育システム情報学会全国大会 予稿集、2020、235-236
  • 【教育工学】 柳川 信・讃岐 勝・片山 京子、医学部の授業におけるオンデマンド配信はどこまで可能か?-個人情報と著作権よる視点から-、第45回教育システム情報学会全国大会 予稿集、2020、251-252
  • 【数式処理】 讃岐 勝、多変数多項式の近似GCD計算のための多項式要素の部分終結式行列のnull空間の効率的な計算、日本数式処理学会第29回大会 (2020年10月31日-11月1日)
  • 【数式処理】 佐々木建昭・讃岐勝・稲葉大樹・加古富志雄、疎な多変数多項式系の高速な変数消去法の探求 (II)、RIMS 共同研究 (公開型)Computer Algebra -- Theory and its Applications(2020年12月22日-月24日)
  • 【BioInformatics・機械学習】 Keitaro Kume, A machine learning approach for prediction of mitochondrial proteins in non-model organisms, RIKEN iTHEMS Biology Seminar, 2021-02
  • 【数式処理】 讃岐 勝、部分終結式行列による多変数近似GCDの計算の効率化 ---行列が特異な場合---、Risa/Asir Conference 2021 (2021年3月20日-21日)

Others

  • 【医学教育】 鈴木 英雄・木村 友和・讃岐 勝・大川 敬子・前野 貴美・堀内 明由美・前野 哲博・桝 正幸・田中 誠、COVID-19感染拡大による自粛下の筑波大学消化器内科におけるオンライン臨床実習の取り組み、医学教育、51 (3)、2020、219--221
  • 【医学教育】 木村 友和・鈴木 英雄・佐藤 尚江・土田 聡美・郷田 規久子・讃岐 勝・大川 敬子・前野 貴美・高屋敷 明由美・鈴木 將玄・前野 哲博・桝 正幸・田中 誠、筑波大学におけるオンラインテュートリアルの経験、医学教育、51 (3)、2020、258--259
  • 【医学教育】 鈴木 英雄・木村 友和・讃岐 勝・大川 敬子・前野 貴美・堀内 明由美・前野 哲博・桝 正幸・田中 誠, COVID-19感染拡大による自粛下の筑波大学消化器内科におけるオンライン臨床実習の取り組み, 医学教育, 2020, 51 巻, 3 号, p. 282-283.
  • 渡部 衣美・根本 清貴・太刀川 弘和・讃岐 勝・堀 孝文・今井 公文・佐藤 晋爾・山川 百合子・繁田 雅弘・新井 哲明,精神科多職種連携治療・ケアの未来 (特集 多職種チームケアの未来),精神科, 37(2), 87-92, 2020-08

Papers

  • 【BioInfomatics・寄生虫学】 Nobuko Arisue, Tetsuo Hashimoto, Satoru Kawai, Hajime Honma, Keitaro Kume, Toshihiro Horii, Apicoplast phylogeny reveals the position of Plasmodium vivax basal to the Asian primate malaria parasite clade, Sci Rep, 2019-05, doi: 10.1038/s41598-019-43831-1.

Talks

  • 【BioInformatics】 矢﨑裕規, 今泉彩香, 久米慶太郎, 白鳥峻志, 橋本哲男, 矢吹彬憲, 石田健一郎, 稲垣, 祐司, フィロジェノミック解析により推測されたMicroheliella marisの系統的位置, 第3回日本共生学会大会, 2019-11
  • 【BioInformatics】 石谷佳之, 久米慶太郎, 稲垣祐司, 有孔虫Ammonia beccariiのミトコンドリアに局在するDNA分子群, 第3回日本共生学会大会, 2019-11
  • 【数式処理】 讃岐勝、特異値分解とリフティング法に基づく多変数近似GCD 計算とその最適化、RIMS共同研究(公開型)「Computer Algebra - Theory and it's Applications」 (2019年12月16日-18日)
  • 【教育工学】 讃岐勝・柳川信・片山京子、医療系動画コンテンツへの・字幕の付与と・その英訳への取り組み、第14回 医療系eラーニング全国交流会講演要旨集、2019、34-37 (2019年12月21-22日)
  • 【医療情報】 大原 信, 香川璃奈, 讃岐勝, 山中土佐雄, 佐藤真子, 住本美香, 川口寿彦, 古田淳一, 医療安全に資する病院情報システムの構築~筑波大学附属病院の事例紹介~, 大学病院情報マネジメント部門連絡会議, 2020年1月
  • 【BioInformatics】 矢吹彬憲, 矢﨑裕規, 今泉彩香, 白鳥峻志, 久米慶太郎, 橋本哲男, 稲垣祐司, エンドヘレア太陽虫Microheliella marisの系統的位置とミトコンドリアゲノム, 日本藻類学会第44回大会, 2020-03

Poster presentations

  • 【教育工学】 【ポスター】 讃岐勝・柳川信・長谷靖之・天野勝利、動画配信システムを中心に考えた複数システムの連携とそのシステム間の比較、第14回 医療系eラーニング全国交流会講演要旨集、2019、64-67 (2019年12月21-22日)
  • 【ヘルスケア・機械学習】 【インタラクティブ】 大場勇貴・手塚太郎・讃岐勝・我妻ゆき子、健康診断データを用いた疾患予測における解釈可能なモデルの構築、第12回データ工学と情報マネジメントに関するフォーラム(第18回日本データベース学会年次大会 (2020年3月2-4日)
    ★ オンラインプレゼンテーション賞:https://db-event.jpn.org/deim2020/post/awards.html