医学学位プログラムでは、今後の医学・医療分野において国際的に通用する研究者、大学教員等を養成するために、生命システム医学専攻と疾患制御医学専攻を統合し、これまでのディシプリンを超えた教育・研究指導を行う。

教育課程は、研究を進める上で必須である倫理的および法的要件、自ら研究を主体的に計画し、実施する能力、英語によるコミュニケーションやプレゼンテーション能力を涵養し、幅広い分野の方法論や研究動向、研究者としてのキャリアパス等を学ぶ基礎科目と、各専門分野における方法論や最新の研究動向等を学ぶ専門科目から構成される。

学生は研究指導教員が担当する授業のみならず、他の研究室で行われる教育にも参加し、分野融合的視点を涵養する。授業は、原則として、留学生と日本人学生が共に英語で学ぶ環境で行う。また、履修単位の上限を50単位と制限することで、選択した学修内容の充実を図っている。日本人学生ならびに英語よりも日本語が堪能な留学生に対する指導と審査には日本語も用いられる。

• 「医学研究概論」では、生命倫理、研究倫理、情報倫理、組換えDNA実験や動物実験に関する法知識などを身に付ける。
• 「医学特別研究」および「医学特別演習」では、研究指導教員との議論を通じて、学位論文研究課題を設定するとともに、研究計画を主体的に計画して実施し、個々の研究成果を評価し、次の研究実施計画を立案し、最終的に個々の研究成果を積み上げて論文を作成する能力を身に付ける。
• 「医学セミナー」では、医学のさまざまな分野について詳細に議論し、応用力を磨くとともに、科学的文章に対する理解と、文章作成のための技術を身に付ける。
• 「国際実践医学研究特論」や「メディカル・コミュニケーション演習」では、海外の研究者と研究に関して議論し、自身の研究に生かす能力、英語による実習指導を通して、国際的な教育研究者となる能力、自分自身の研究成果について英語で発表し、当該分野の世界の研究者と討論する能力、医科学の広い分野の英語での研究発表を理解し、他の発表に英語で討論する能力を身に付ける。
• 専門科目群の「特論」では、自らの研究成果の発表とそれをもとにした討論を通じて、自立して実験研究を企画・実施・評価する能力を身に付ける。
• 専門科目群の「演習」では、英文原著論文の抄読を行い、専門とする分野における一流の研究の内容と水準を理解し、世界の動向と水準を踏まえて、研究を企画・実施・評価できる能力を身に付ける。以上の医学分野の科目に加えて、関連する分野の基礎的素養や広い視野、汎用的知識・能力の涵養に資するよう、研究群共通科目、学術院共通専門基盤科目、大学院共通科目から2単位を履修することを推奨する。

標準的履修スケジュールを以下に示す。

• 必修科目、選択科目における単位取得は、履修方法・修了要件に従う。
• 3年次前半に、中間評価委員会により、中間評価が行われ、学位論文作成に関する指導を受ける。
• 中間評価に合格し、審査制度の確立している学術雑誌に、英文の原著論文1編以上を第一著者として発表（印刷中を含む）しており、かつ、4年次後半に設置される学位論文予備審査委員会に合格と認定された場合、学位論文提出資格が満たされる。
• 学位論文提出を受けて、学位論文審査委員会が設置され、学位論文審査および最終試験が行われる。

• 3年次前半に、公開発表会が行われ、学位論文研究の進捗状況を発表する。主査1名、副査3名により中間評価委員会が構成され、発表内容および中間研究報告書に基づき、学位論文作成に向けての評価と指導を行う。
• 4年次後半に、主査1名、副査3名により学位論文予備審査委員会が構成され、公開発表会および予定される学位論文の内容に基づき、評価と論文作成指導を行う。学位論文予備審査委員会に合格と認定された場合、学位論文提出資格が満たされる。
• 学位論文提出を受けて、主査1名、副査3名により学位論文審査委員会が設置され、学位論文審査および最終試験が行われる。

1. 1. 医学の発展に寄与するオリジナルな研究成果が、科学論文として発表するのに相応しい量含まれていること。
2. 2. 研究の目的、方法、結果、考察が学位論文に相応しい形式にまとめてあること。
3. 3. 研究成果の信頼性が充分に検証されていること。
4. 4. 研究成果に対する考察が妥当であること。
5. 5. 関連分野の世界における研究動向が把握され、当該研究成果の意義が明確に述べられていること。

• 学位論文審査委員会は、主査1名および副査3名により構成される。主査と副査の候補は、医学学位プログラムリーダーと教務委員会委員の合議により選出し、人間総合科学学術院運営委員会において学位論文審査委員会の設置が決定される。
• 主査候補は人間総合科学研究群の研究指導教員から選出する。
• 副査候補は、人間総合科学研究群の研究指導教員または授業担当教員から選出する。なお、本学大学院の他研究科、他大学の大学院教員、またはそれと同等以上の研究業績を有すると医学学位プログラム運営委員会が認めた者を副査候補に加えることができる。
• 学位論文審査委員会は、学位論文予備審査委員会と同一の主査・副査を候補者とすることを原則とする。

• 標準的履修スケジュールにおいては、3年次前半に公開発表会が行われ、学位論文研究の進捗状況を発表する。主査1名、副査3名により中間評価委員会が構成され、発表内容および中間研究報告書に基づき、学位論文作成に向けての評価と指導を行う。
• 4年次後半に、主査1名、副査3名により学位論文予備審査委員会が構成され、公開発表会および予定される学位論文の内容に基づき、評価と論文作成指導を行う。
• 中間評価に合格し、審査制度の確立している学術雑誌に、英文の原著論文1編以上を第一著者として発表（印刷中を含む）しており、かつ、学位論文予備審査委員会に合格と認定された場合、学位論文提出資格が満たされる。
• 学位論文提出を受けて、学位論文審査委員会が設置され、学位論文審査および最終試験が行われる。

1. 1. 博士（医学）を授与するに値する人格とコミュニケーション能力が備わっていること。
2. 2. 医学研究を行う際に準拠すべき法的及び倫理的要件について説明できること。
3. 3. 当該博士論文研究の目的、方法、結果とその意味について説明できること。
4. 4. 研究成果の信頼性について科学的に論考し、説明できること。
5. 5. 関連分野の世界における研究動向を把握し、当該研究の意義について説明できること。
6. 6. 当該研究成果に基づき、関連分野の動向を正しく理解し、オリジナルな研究をより進展させるためのさらなる研究を主体的に計画し実施し学術論文として公表する能力があること。